Το 2ο Λύκειο Μεγάρων από το 1988, έτος ίδρυσης και λειτουργίας, έως τον Ιούνιο του 2004, συστεγαζόταν με το 1ο Λύκειο στην οδό Μουσείου 1, στα Μέγαρα.
Από το Σχολικό Έτος 2004-2005, μεταφέρθηκε σε ιδιόκτητο κτίριο στο τέρμα της οδού Ρήγα Φεραίου.
Διευθυντής του 2ου ΓΕΛ Μεγάρων είναι η κα. Παπαπανούση Χριστίνα, οικονομίας.
Υποδιευθυντής είναι ο κ. Μεγάλος Αναστάσιος, οικονομίας.
Διατελέσαντες Διευθυντές (με χρονολογική σειρά)
Παπαπανούση Χριστίνα (Οικονομίας)(2023)
Κάρκα Άννα, Φιλόλογος (2020-2022)
Προίσκος Γεώργιος, Μαθηματικός (2018-2020)
Γεωργούλης Γρηγόριος, Μαθηματικός (2014-2018)
Αλέκος Λάμπρος, Φιλόλογος (2011 - 23/12/2013)
Σιαράβας Αλέξανδρος, Φιλόλογος (2002-2011)
Σπυράτος Αλέξανδρος, Μαθηματικός (1990-2002)
Μπακαούκας Σπυρίδωνας, Θεολόγος, Ιερεύς (1988-1990)
Το 2ο ΓΕΛ Μεγάρων ανήκει διοικητικά στη Διεύθυνση Δευτεροβάθμιας Εκπαίδευσης Δυτικής Αττικής.